化学交联结合质谱技术 (chemical cross-linking coupled with mass spectrometry, CXMS) 十年来蓬勃发展,广泛应用于蛋白质结构鉴定和蛋白质相互作用分析。 然而, CXMS技术可利用的化学交联剂有限, 交联效率不够高, 限制了该技术的应用[1]:
近期,北京大学雷晓光教授开发的新型赖氨酸特异性可富集型交联剂——Leiker,可实现复杂蛋白质样品高效、定量检测[1]。
Leiker的结构特点:
图1:(A)Leiker包含一条9.3-Å碳链, 两端各连接一个磺基-NHS酯, 可将两个赖氨酸交联在一起; 还含一个用于亲和纯化的生物素标记结构(洋红色部分), 一个裂解位点(箭头所指位置), 以及可用同位素标记的六个氢原子(星号标记)——可用来将交联肽从链霉亲和素磁珠上释放出来[1]。(B)Leiker结合多肽的纯化流程(C)Leiker结合多肽的三种方式
Leiker与传统交联剂BS3相比,有如下优点:
可有效富集97%以上多肽,实现复杂蛋白样品高效分析
图2:Leiker allowed near 100% enrichment of target peptides from a cross-linked ten-protein mixture diluted with increasing amounts of non-cross-linked E. coli lysates.
交联效率高10倍以上
图3:CXMS analyses of E. coli and C. elegans lysates. The best protein-protein interaction cluster extracted from the Leiker-identified or BS3-identified (Yang et al., 2012) inter-links from E.coli whole-cell lysates.
氘代同位素标记的d6-Leiker可实现CXMS定量分析
例:L7Ae-RNA 复合物定量分析
图4:Reciprocal labeling of RNA-free (F) and RNA-bound (B) L7Ae with [d0]/[d6]-Leiker.
百灵威向全球科学家提供雷晓光教授科研成果转化的Leiker系列产品:
- Tan D, Li Q, Zhang M J, et al. Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and comparing protein conformational states. Elife Sciences, 2016, 5.
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