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化学和物理性质
产品描述
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UNC1999一种有效的具有口服活性的EZH2和EZH1选择性抑制剂,无细胞试验中IC50分别为2 nM和45 nM,对广泛表观遗传学相关或不相关的靶点选择性大于1000倍。
靶点(IC50 & Targe)
EZH1,45nM
EZH2,2nM
体外研究
UNC1999在体外对EZH2 Y641和EZH2 Y641F突变体有很强的抑制活性。UNC1999浓度依赖性的减少了MCF10A细胞系中H3K27me3的水平,其IC50为124 nM,产生了较低的细胞毒性。在含有EZH2Y641N突变的DLBCL细胞系中UNC1999显示出对细胞增殖有效的浓度依赖性的抑制。另外,生物素化的UNC1999可以从HEK293T细胞裂解液中分离EZH2,因此能够被用在化学蛋白组学研究。
体内研究
UNC1999 (150 and 50 mg/kg, i.p.)体内处理使其在24小时以上的时间内保持在血浆中的浓度高于其细胞IC50值。另外,UNC1999对小鼠有口服活性,从而可以更实用和方便的用于慢性动物实验。
激酶实验
临近闪烁分析法:
以氚代腺苷甲硫氨酸接合生物素标记的多肽作为底物,采用闪烁迫近分析法检测甲基转移酶活力。反应缓冲液系统: 50 mM Tris pH 9.0, 5 mM DTT, 0.01% TritonX-100(for SMYD2 and SMYD3 ); 25 mM 磷酸钾 pH 8.0, 1 mM EDTA, 2 mM MgCl2 and 0.01% Triton X-100 (for G9a, GLP and SUV39H2); 20 mM Tris pH 8.0, 5 mM DTT, 0.01% TritonX-100 (for other HMTs)。加入10 μL of 7.5 M 盐酸胍淬灭酶反应后加入缓冲液,转移至384孔板,孵育并计数。无化合物的度数记为100%,无酶时计数记为0%。100 nM-100 μM的化合物被用于检测IC50.
细胞实验
Cell lines: 含有EZH2Y641N突变体的DLBCL细胞系
Concentrations: ~5 μM
Incubation Time: 8天
Method:DB细胞系,一种具有高度扩散性的包含EZH2 Y641N突变的B细胞淋巴瘤细胞系,从ATCC中获得并在添加了10%胎牛血清、抗生素和各种浓度的化合物(DMSO control, UNC1999, or UNC2400)的RPMI 1640培养。含有被测抑制剂或者空白对照的培养基,每三天更换一次。使用TC20自动细胞计数系统测量活细胞数目至少需要三次独立实验。总组蛋白按照酸性萃取步骤从细胞核中取出。大约1 μg总族蛋白用15% SDS-PAGE分离,转移到PVDF细胞膜,组蛋白抗体探测。被用于这个实验的抗体是针对EZH2, general H3, and H3K27me3。
(Only for Reference)
动物实验
Animal Models: 雄性瑞士白化小鼠
Formulation: DMSO
Dosages: ~150 mg/kg (i.p.), ~50 mg/kg (口服)
Administration: 腹腔注射或口服
(Only for Reference)
参考文献
[1] Konze KD, et al. ACS Chem. Biol. 2013, 8 (6), 1324–1334.
[2] Structural Genomics Consortium.