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基本信息
英文别名N-Phthalyl-L-tryptophan | |
中文别名N-酞酰-L-色氨酸 |
安全信息
存储条件Freezer -20℃ |
化学和物理性质
产品描述
产品描述
RG108是一种DNA methyltransferase抑制剂，无细胞试验中IC50为115 nM，不会引起共价酶的诱捕。
靶点（IC50 & Targe）
DNA methyltransferase (DNMT),115nM
体外研究
RG108有效阻断体外人细胞系中DNA甲基转移酶，并且不会引起共价酶俘获。细胞用低微摩尔浓度的RG108培育，导致基因组DNA显著脱甲基化，而没有可检测的毒性。有趣的是，RG108引起肿瘤抑制基因脱甲基和再活化，但是它不影响着丝粒基因序列的甲基化。[1]在另一个研究中，进行生物素化RG108缀合物的合成和体外分析以评估与DNA甲基转移酶的相互作用。[2]最近的研究表明，与天然SMs相比，RG108能够显著降低SM衍生的iPS细胞中DNA活性。[3]
激酶实验
体外甲基化试验:
体外甲基化试验中底物DNA是来自人p16Ink4a基因启动子区域的798 bp片段(−423/+375相对于起始密码子)。甲基化反应包含350到400 ng底物DNA和4 单位M.SssI甲基化酶(0.5 μM)，终体积为50 μL。抑制剂分别以10，100，200，和500 μM浓度加入。反应在37 °C下进行2小时。完成后，反应在65 °C下灭活15分钟，DNA使用PCR纯化试剂盒纯化。300 ng纯化的DNA在60 °C下与30单元BstUI 处理3小时，在2% Tris-硼酸盐EDTA琼脂糖凝胶上分析。
细胞实验
Cell lines: HCT116 细胞
Concentrations: 1-100 μM
Incubation Time: 5天
Method: 对于细胞生长和活性的测定，细胞用台盼蓝着色，并使用标准计数栅技术。
(Only for Reference)
参考文献
[1] Brueckner B, et al, Cancer Res, 2005, 65(14), 6305-6311.
[2] Schirrmacher E, et al, Bioconjug Chem, 2006, 17(2), 261-266.
[3] Pasha Z, et al, PLoS One, 2011, 6(8), e23667.
