抗坏血酸过氧化物酶(APEX) 作为一种工程化的过氧化酶,能催化生物素连接的苯酚(BP)底物的单电子氧化,产生的苯氧基自由基能迅速与附近蛋白质上的富电子氨基酸侧链形成共价连接,对附近的蛋白质进行标记
[1]。
邹鹏研究员课题组通过探针合成和活性筛选,确定了一种炔烃修饰的芳香族APEX2—底物炔烃-苯酚(Alk-Ph)
[2],其在完整酵母细胞中展现出增强的标记效率。此外,Alk-Ph还促进了APEX标记位点的鉴定,可以明确地确定线粒体蛋白质的膜拓扑结构。因此,APEX2介导的Alk-Ph标记可以广泛应用于酵母亚细胞蛋白质组和转录组分析,这为APEX2介导的邻近标记的微生物蛋白质组研究开辟了新的途径。
百灵威提供郭邹鹏研究员科研转化成果:
APEX底物——炔基苯酚(Alkyne-Phenol,Alk-Ph)产品
产品列表
品名 | CAS | 货号 |
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Alkyne-phenol, 95% 炔基苯酚 | 1694495-59-4 | 9186096
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参考文献
- Rhee, H.-W., Zou, P., Udeshi, N.D., Martell, J.D., Mootha, V.K., Carr, S.A., and Ting, A.Y. Proteomic Mapping of Mitochondria in Living Cells via Spatially Restricted Enzymatic Tagging[J]. 2013,Science 339, 1328-1331.
- Li, Y., Tian, C., Liu, K., Zhou, Y., Yang, J., and Zou, P. A Clickable APEX Probe for Proximity-Dependent Proteomic Profiling in Yeast[J].2020,Cell Chem Biol 27, 858-865.e858.
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