目前常用的蛋白质结构分析方法是X射线晶体分析和生物NMR。

蛋白质结构示意图^[1]

X射线晶体分析

优点是速度快，不受蛋白大小限制，只要能结晶，就可以进行X射线衍射，收集衍射图谱，得到蛋白质的原子结构。但瓶颈是摸索合适的结晶条件，得到蛋白质的晶体。

生物NMR

利用核磁共振原理，可以对溶液中和非晶态的蛋白质进行分析。其中蛋白质的同位素标记表达对生物核磁研究具有巨大的推动作用，常用的同位素有¹⁵N，¹³C等。

小分子蛋白无需同位素标记，400、500MHz的小型谱仪即可分析；10K以上的蛋白，需要磁场更强的600、800MHz的核磁谱仪。

其他蛋白相关修饰方法

1. Benkert P, Biasini M, Schwede T. Structural bioinformatics. 2011, 27, 343–350.