邹鹏研究员科研成果 | APEX技术新型底物——Alk-Ph

时间: 2024-07-17
作者: 百灵威
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邹鹏研究员科研成果 | APEX技术新型底物——Alk-Ph-百灵威
    工程抗坏血酸过氧化物酶(APEX2)用于探索活细胞中蛋白相互作用。APEX2技术不仅能实现对特定蛋白的靶向和临近性标记,还实现了亚细胞室的蛋白质组学定位以及动态蛋白质复合物的识别。
    APEX2技术的发展为蛋白质组学领域带来了新的研究方法,为理解细胞内复杂的蛋白质网络提供了强有力的工具。这项技术已在多种类型的蛋白质组学研究中得到应用,并且其应用范围还在不断扩大,这对于揭示生命过程的分子机制至关重要。
    北京大学邹鹏研究员课题组设计并成功合成新一代应用于微生物体系的APEX底物——炔基苯酚(Alkyne-Phenol,Alk-Ph)[1]
和传统底物BP相比,有如下优势
• 分子体积更小(MW: 217.27);
• 细胞壁和细胞膜穿透性能更好,水溶液中溶解度更高;
• 良好空间特异性和更高覆盖度,使APEX标记效率提高一个数量级。
    邹鹏研究员课题组已成功在活酵母细胞中使用Alk-Ph对蛋白质(图1)和RNA进行邻近标记,并利用定量蛋白质组和转录组学数据证明了该探针具有良好的空间特异性和更高的覆盖度。


图1 APEX Labeling of Yeast Subcellular Proteome[1]. (A)Scheme of APEX-mediated labeling with Alk-Ph probe in yeast. (B)Confocal fluorescence images of W303 yeast cells expressing Su9-APEX2-eGFP, Su9-eGFP, and NLS-APEX2-eGFP.

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品名 CAS 货号
Alkyne-phenol, 95%
炔基苯酚
1694495-59-4 9186096
参考文献
  1. 1、Li, Y., Tian, C., Liu, K., Zhou, Y., Yang, J., and Zou, P. (2020). A Clickable APEX Probe for Proximity-Dependent Proteomic Profiling in Yeast. Cell Chem Biol 27, 858-865.e858.
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